Program Unggulan Prodi Kebidanan Magetan adalah dalam bidang DETEKSI DINI TUMBUH KEMBANG ANAK. Program unggulan ini dituangkan dalam visi dan misi prodi, dan dikembangkan melalui:
1) Program pendidikan, yang diwujudkan dalam mata kuliah muatan lokal
2) Penelitian, yang diwujudkan dan kegiatan-kegiatan penelitian dosen dan mahasiswa, termasuk melalui publikasi dalam jurnal ilmiah
3) Pengabdian kepada masyarakat, yang diwujudkan dalam bentuk pembinaan tumbuh kembang anak di lembaga pendidikan anak usia dini (TK/ PAUD) serta di wilayah kerja dinas kesehatan